依據藥事法第41條規定，為提升藥物製造工業水準與臨床試驗品質，新興藥物科技之研究發展，對致力於新藥物、相關產製技術之研發及配合政府推動相關政策成效卓越者，由衛生福利部與經濟部共同獎勵之。

衛生福利部於民國89年與經濟部會銜發布「藥物科技研究發展獎勵辦法」，將研發產品分為藥品類、醫療器材類及製造技術類3類，並依其貢獻程度分別授予金質獎、銀質獎、銅質獎，並公開表揚之。

108年度為「衛福部‧經濟部藥物科技研究發展獎」第18次辦理，歡迎國內生技產業業者踴躍參與，辛苦的研發成果應該讓更多人看見與了解，投資與產業相互帶動成長，台灣生技製藥產業才能長遠經營、不斷向上提升競爭優勢。

第一條	本辦法依藥事法第四十一條第二項規定訂定之。
第二條	本辦法所稱藥物，指藥事法所稱之藥品及醫療器材。
第三條	本辦法適用獎勵對象為國內之藥物製造廠及從事藥物研發之自然人、法人、機構或團體，其研發成果符合本辦法之獎勵條件者。
第四條	本辦法適用之獎勵條件如下： 一、 國內自行研發，取得國內（外）專利，在我國或其他先進國家首先上市之新發明藥物者。 二、 取得國內（外）專利之授權，在國內研發，所生產製品為我國或其他先進國家首先核准或上市之新發明藥物者。 三、 國內研發之未上市藥物，取得國內（外）專利或授權，且經核准在國內（外）進行臨床試驗研究，有具體成效者。（人體試驗階段一、階段二或階段三，各階段得分別提出申請獎勵） 四、 國內研發或製造藥物，有重要且具體之市場成效者。 五、 國內研發或製造藥物以進步性，取得國內外專利，且對藥物製造工業發展有具體貢獻者。 六、 國內研發或製造之新原料藥、賦形劑、醫療器材材質、零組件，對提昇我國藥物製造工業有顯著貢獻者。 七、 引進國外先進科技，於國內研究並產製生物製劑藥品，對國人疾病之醫療有顯著貢獻者。 八、 國內自行開發新設備裝置、製程或分析檢驗方法，對改進藥物製造或檢驗技術有重大成效者。 九、 配合中央衛生或工業主管機關政策，推動本國藥物製造工業發展，提昇藥物研發水準，績效卓著者。
第五條	為審議依本辦法申請獎勵之案件，應組成藥物研發審議會（以下簡稱審議會）。 審議會置委員九人至十三人，由中央衛生主管機關、中央工業主管機關、科技相關代表、學術機構、工業界之代表及有關學者共同遴選組成。 審議會由委員相互推選一人為主席。 審議會委員均為無給職。 審議會之任務如下： 一、 審查獎勵對象之資格。 二、 審議各項獎勵申請案件。 三、 核定獎勵名額及核給獎勵點數。 四、 其他依本辦法應經審議會審議之事項。
第六條	依本辦法申請獎勵之案件，應由審議會審議通過後，再由中央衛生主管 機關會同中央工業主管機關獎勵之。 前項之申請審議，每年辦理一次。必要時得增加辦理次數。
第七條	符合第四條規定，並經審議會審議通過之受獎勵者，得頒給獎狀或獎金，獎金額度依下列標準計點核給之獎金： 一、 符合第四條第一款之條件者：六十點至一百點。 二、 符合第四條第二款或第三款之條件者：五十點至八十點。 三、 符合第四條第四款至第八款條件之一者：三十點至七十點。 四、 符合第四條第九款之條件者：二十點至五十點。 每點獎金之數額，按年由中央衛生及工業主管機關訂定之。
第八條	本辦法所需之獎勵經費，由下列財源籌措： 一、 中央衛生及工業主管機關逐年編列預算支應。 二、 產業界捐贈之回饋金。 三、 私人或團體指定用於本辦法獎勵之捐助。
第九條	遇二個以上獎勵對象，為相同之發明或研究，分別申請獎勵時，應就最先申請者獎勵之。二個以上獎勵對象共同申請獎勵時，其所受獎勵為該共同申請人所共有。
第十條	獎勵對象符合第四條之獎勵條件者，得由相關公、協、學會等團體推薦或直接向中央衛生主管機關提出申請。
第十一條	本辦法自發布日施行。